Sistem subsidi yang luas Malaysia telah dikaitkan dengan kekurangan dan penyeludupan komoditi. Nelayan Malaysia sering meninggalkan nelayan untuk menjual bahan api untuk bot mereka kepada rakan-rakan mereka di negara-negara seperti Thailand dan Indonesia yang tidak menawarkan subsidi yang sama. Menurut Menteri Perdagangan Dalam Negeri, Koperasi dan Kepenggunaan, Ismail Sabri Yaakob, perniagaan yang memenuhi syarat untuk gula bersubsidi, secara dramatis terlalu keras dan secara haram menjual lebihannya kepada industri yang tidak disasarkan untuk subsidi. Skim sedemikian kadang-kadang boleh membuat sukar bagi pengguna untuk mencari dan membeli komoditi.[9]